Protein–RNA interactions for Protein: P52955

Lbx1, Transcription factor LBX1, mousemouse

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Length 282 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lbx1P52955 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lbx1P52955 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lbx1P52955 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lbx1P52955 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lbx1P52955 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lbx1P52955 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lbx1P52955 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lbx1P52955 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lbx1P52955 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lbx1P52955 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lbx1P52955 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lbx1P52955 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lbx1P52955 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lbx1P52955 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lbx1P52955 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Lbx1P52955 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Lbx1P52955 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Lbx1P52955 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lbx1P52955 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lbx1P52955 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lbx1P52955 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lbx1P52955 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lbx1P52955 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lbx1P52955 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Lbx1P52955 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Lbx1P52955 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lbx1P52955 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lbx1P52955 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lbx1P52955 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lbx1P52955 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lbx1P52955 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lbx1P52955 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lbx1P52955 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lbx1P52955 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lbx1P52955 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lbx1P52955 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lbx1P52955 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lbx1P52955 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lbx1P52955 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lbx1P52955 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lbx1P52955 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lbx1P52955 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lbx1P52955 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lbx1P52955 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Lbx1P52955 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Lbx1P52955 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lbx1P52955 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Lbx1P52955 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lbx1P52955 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lbx1P52955 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lbx1P52955 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lbx1P52955 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lbx1P52955 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lbx1P52955 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lbx1P52955 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lbx1P52955 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lbx1P52955 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lbx1P52955 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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Lbx1P52955 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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Lbx1P52955 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Lbx1P52955 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
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Lbx1P52955 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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