Protein–RNA interactions for Protein: P52483

Ube2e3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3P52483 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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