Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ClgnP52194 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ClgnP52194 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ClgnP52194 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ClgnP52194 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ClgnP52194 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ClgnP52194 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ClgnP52194 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ClgnP52194 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ClgnP52194 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ClgnP52194 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ClgnP52194 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ClgnP52194 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ClgnP52194 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ClgnP52194 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ClgnP52194 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ClgnP52194 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ClgnP52194 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ClgnP52194 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ClgnP52194 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ClgnP52194 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ClgnP52194 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ClgnP52194 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ClgnP52194 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ClgnP52194 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ClgnP52194 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ClgnP52194 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ClgnP52194 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ClgnP52194 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ClgnP52194 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ClgnP52194 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ClgnP52194 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ClgnP52194 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ClgnP52194 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ClgnP52194 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ClgnP52194 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ClgnP52194 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ClgnP52194 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ClgnP52194 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ClgnP52194 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ClgnP52194 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ClgnP52194 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ClgnP52194 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ClgnP52194 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ClgnP52194 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ClgnP52194 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ClgnP52194 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ClgnP52194 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ClgnP52194 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ClgnP52194 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ClgnP52194 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ClgnP52194 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ClgnP52194 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ClgnP52194 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ClgnP52194 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ClgnP52194 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ClgnP52194 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ClgnP52194 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ClgnP52194 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ClgnP52194 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ClgnP52194 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ClgnP52194 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ClgnP52194 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ClgnP52194 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ClgnP52194 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ClgnP52194 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ClgnP52194 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ClgnP52194 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ClgnP52194 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ClgnP52194 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ClgnP52194 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ClgnP52194 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ClgnP52194 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ClgnP52194 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ClgnP52194 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ClgnP52194 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ClgnP52194 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ClgnP52194 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ClgnP52194 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ClgnP52194 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ClgnP52194 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ClgnP52194 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ClgnP52194 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ClgnP52194 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ClgnP52194 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ClgnP52194 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ClgnP52194 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ClgnP52194 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ClgnP52194 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ClgnP52194 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ClgnP52194 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ClgnP52194 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ClgnP52194 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ClgnP52194 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ClgnP52194 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ClgnP52194 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ClgnP52194 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ClgnP52194 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ClgnP52194 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ClgnP52194 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms