Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apobec1P51908 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apobec1P51908 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apobec1P51908 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apobec1P51908 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apobec1P51908 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Apobec1P51908 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apobec1P51908 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Apobec1P51908 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apobec1P51908 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apobec1P51908 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Apobec1P51908 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apobec1P51908 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apobec1P51908 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apobec1P51908 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apobec1P51908 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Apobec1P51908 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apobec1P51908 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apobec1P51908 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apobec1P51908 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apobec1P51908 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apobec1P51908 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apobec1P51908 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apobec1P51908 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apobec1P51908 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apobec1P51908 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apobec1P51908 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Apobec1P51908 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apobec1P51908 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apobec1P51908 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apobec1P51908 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Apobec1P51908 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apobec1P51908 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apobec1P51908 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apobec1P51908 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apobec1P51908 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apobec1P51908 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apobec1P51908 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apobec1P51908 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apobec1P51908 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apobec1P51908 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apobec1P51908 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apobec1P51908 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apobec1P51908 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apobec1P51908 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apobec1P51908 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apobec1P51908 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apobec1P51908 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apobec1P51908 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apobec1P51908 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apobec1P51908 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apobec1P51908 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apobec1P51908 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apobec1P51908 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apobec1P51908 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apobec1P51908 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apobec1P51908 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Apobec1P51908 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Apobec1P51908 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Apobec1P51908 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Apobec1P51908 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Apobec1P51908 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Apobec1P51908 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Apobec1P51908 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apobec1P51908 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apobec1P51908 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apobec1P51908 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apobec1P51908 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apobec1P51908 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Apobec1P51908 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apobec1P51908 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apobec1P51908 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Apobec1P51908 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apobec1P51908 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apobec1P51908 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apobec1P51908 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apobec1P51908 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apobec1P51908 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apobec1P51908 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apobec1P51908 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apobec1P51908 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apobec1P51908 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apobec1P51908 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apobec1P51908 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apobec1P51908 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apobec1P51908 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apobec1P51908 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apobec1P51908 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apobec1P51908 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Apobec1P51908 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apobec1P51908 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apobec1P51908 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apobec1P51908 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apobec1P51908 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apobec1P51908 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apobec1P51908 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apobec1P51908 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apobec1P51908 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Apobec1P51908 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Apobec1P51908 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms