Protein–RNA interactions for Protein: P51682

Ccr5, C-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr5P51682 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccr5P51682 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccr5P51682 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccr5P51682 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccr5P51682 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccr5P51682 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccr5P51682 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccr5P51682 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccr5P51682 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccr5P51682 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccr5P51682 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccr5P51682 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccr5P51682 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccr5P51682 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccr5P51682 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccr5P51682 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccr5P51682 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccr5P51682 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccr5P51682 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccr5P51682 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccr5P51682 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccr5P51682 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccr5P51682 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccr5P51682 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccr5P51682 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccr5P51682 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccr5P51682 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccr5P51682 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccr5P51682 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccr5P51682 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccr5P51682 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccr5P51682 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccr5P51682 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccr5P51682 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccr5P51682 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccr5P51682 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccr5P51682 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccr5P51682 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccr5P51682 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccr5P51682 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccr5P51682 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccr5P51682 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccr5P51682 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccr5P51682 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccr5P51682 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccr5P51682 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccr5P51682 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccr5P51682 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccr5P51682 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccr5P51682 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccr5P51682 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccr5P51682 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccr5P51682 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccr5P51682 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccr5P51682 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccr5P51682 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccr5P51682 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccr5P51682 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccr5P51682 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccr5P51682 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccr5P51682 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccr5P51682 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccr5P51682 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccr5P51682 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccr5P51682 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccr5P51682 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccr5P51682 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccr5P51682 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccr5P51682 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccr5P51682 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccr5P51682 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccr5P51682 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccr5P51682 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccr5P51682 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccr5P51682 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccr5P51682 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccr5P51682 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccr5P51682 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccr5P51682 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccr5P51682 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccr5P51682 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccr5P51682 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccr5P51682 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccr5P51682 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccr5P51682 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccr5P51682 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccr5P51682 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccr5P51682 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccr5P51682 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccr5P51682 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccr5P51682 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccr5P51682 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccr5P51682 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccr5P51682 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccr5P51682 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccr5P51682 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccr5P51682 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccr5P51682 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccr5P51682 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccr5P51682 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms