Protein–RNA interactions for Protein: P50652

Fancc, Fanconi anemia group C protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FanccP50652 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FanccP50652 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FanccP50652 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FanccP50652 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FanccP50652 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FanccP50652 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FanccP50652 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FanccP50652 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FanccP50652 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FanccP50652 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FanccP50652 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FanccP50652 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
FanccP50652 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FanccP50652 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FanccP50652 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FanccP50652 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FanccP50652 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FanccP50652 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FanccP50652 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FanccP50652 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FanccP50652 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FanccP50652 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FanccP50652 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FanccP50652 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FanccP50652 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FanccP50652 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FanccP50652 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
FanccP50652 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FanccP50652 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FanccP50652 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FanccP50652 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FanccP50652 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FanccP50652 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FanccP50652 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FanccP50652 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FanccP50652 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FanccP50652 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FanccP50652 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FanccP50652 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FanccP50652 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FanccP50652 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FanccP50652 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FanccP50652 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FanccP50652 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FanccP50652 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FanccP50652 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FanccP50652 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FanccP50652 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FanccP50652 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FanccP50652 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FanccP50652 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FanccP50652 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FanccP50652 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FanccP50652 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FanccP50652 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FanccP50652 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FanccP50652 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FanccP50652 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FanccP50652 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FanccP50652 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FanccP50652 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FanccP50652 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FanccP50652 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FanccP50652 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FanccP50652 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FanccP50652 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FanccP50652 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FanccP50652 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FanccP50652 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FanccP50652 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FanccP50652 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FanccP50652 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FanccP50652 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
FanccP50652 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FanccP50652 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
FanccP50652 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FanccP50652 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FanccP50652 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
FanccP50652 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FanccP50652 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FanccP50652 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FanccP50652 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FanccP50652 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FanccP50652 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FanccP50652 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FanccP50652 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FanccP50652 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FanccP50652 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FanccP50652 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FanccP50652 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
FanccP50652 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FanccP50652 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FanccP50652 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FanccP50652 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FanccP50652 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
FanccP50652 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FanccP50652 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FanccP50652 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FanccP50652 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FanccP50652 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms