Protein–RNA interactions for Protein: P50481

Lhx3, LIM/homeobox protein Lhx3, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx3P50481 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lhx3P50481 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lhx3P50481 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lhx3P50481 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lhx3P50481 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lhx3P50481 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lhx3P50481 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Lhx3P50481 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lhx3P50481 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lhx3P50481 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lhx3P50481 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lhx3P50481 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lhx3P50481 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lhx3P50481 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lhx3P50481 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lhx3P50481 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lhx3P50481 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lhx3P50481 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lhx3P50481 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lhx3P50481 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lhx3P50481 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lhx3P50481 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lhx3P50481 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lhx3P50481 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lhx3P50481 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lhx3P50481 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lhx3P50481 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lhx3P50481 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lhx3P50481 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lhx3P50481 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lhx3P50481 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lhx3P50481 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lhx3P50481 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Lhx3P50481 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lhx3P50481 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lhx3P50481 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lhx3P50481 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lhx3P50481 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lhx3P50481 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lhx3P50481 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lhx3P50481 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lhx3P50481 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lhx3P50481 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lhx3P50481 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lhx3P50481 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lhx3P50481 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lhx3P50481 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lhx3P50481 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lhx3P50481 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lhx3P50481 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Lhx3P50481 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lhx3P50481 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lhx3P50481 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Lhx3P50481 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lhx3P50481 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Lhx3P50481 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lhx3P50481 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lhx3P50481 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lhx3P50481 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lhx3P50481 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lhx3P50481 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lhx3P50481 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lhx3P50481 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lhx3P50481 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lhx3P50481 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lhx3P50481 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lhx3P50481 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lhx3P50481 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lhx3P50481 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lhx3P50481 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lhx3P50481 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lhx3P50481 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lhx3P50481 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Lhx3P50481 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lhx3P50481 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lhx3P50481 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lhx3P50481 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lhx3P50481 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lhx3P50481 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lhx3P50481 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lhx3P50481 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lhx3P50481 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lhx3P50481 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lhx3P50481 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lhx3P50481 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lhx3P50481 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lhx3P50481 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lhx3P50481 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lhx3P50481 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lhx3P50481 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lhx3P50481 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lhx3P50481 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lhx3P50481 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lhx3P50481 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lhx3P50481 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lhx3P50481 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lhx3P50481 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lhx3P50481 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lhx3P50481 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lhx3P50481 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms