Protein–RNA interactions for Protein: P50405

Sftpb, Pulmonary surfactant-associated protein B, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpbP50405 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SftpbP50405 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SftpbP50405 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SftpbP50405 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SftpbP50405 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SftpbP50405 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SftpbP50405 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SftpbP50405 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SftpbP50405 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SftpbP50405 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SftpbP50405 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SftpbP50405 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SftpbP50405 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SftpbP50405 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms