Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SftpdP50404 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SftpdP50404 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SftpdP50404 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SftpdP50404 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SftpdP50404 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SftpdP50404 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SftpdP50404 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SftpdP50404 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SftpdP50404 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SftpdP50404 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SftpdP50404 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SftpdP50404 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SftpdP50404 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SftpdP50404 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SftpdP50404 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SftpdP50404 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SftpdP50404 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SftpdP50404 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SftpdP50404 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SftpdP50404 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SftpdP50404 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SftpdP50404 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SftpdP50404 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SftpdP50404 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SftpdP50404 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SftpdP50404 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SftpdP50404 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SftpdP50404 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SftpdP50404 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SftpdP50404 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SftpdP50404 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SftpdP50404 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SftpdP50404 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SftpdP50404 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SftpdP50404 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SftpdP50404 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SftpdP50404 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SftpdP50404 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SftpdP50404 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SftpdP50404 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SftpdP50404 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SftpdP50404 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SftpdP50404 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SftpdP50404 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SftpdP50404 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SftpdP50404 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SftpdP50404 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SftpdP50404 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SftpdP50404 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SftpdP50404 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SftpdP50404 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SftpdP50404 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SftpdP50404 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SftpdP50404 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SftpdP50404 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SftpdP50404 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SftpdP50404 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SftpdP50404 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SftpdP50404 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SftpdP50404 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SftpdP50404 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SftpdP50404 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SftpdP50404 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SftpdP50404 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SftpdP50404 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SftpdP50404 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SftpdP50404 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SftpdP50404 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SftpdP50404 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SftpdP50404 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SftpdP50404 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SftpdP50404 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SftpdP50404 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SftpdP50404 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SftpdP50404 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SftpdP50404 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SftpdP50404 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SftpdP50404 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SftpdP50404 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SftpdP50404 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SftpdP50404 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SftpdP50404 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SftpdP50404 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SftpdP50404 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SftpdP50404 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SftpdP50404 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SftpdP50404 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SftpdP50404 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SftpdP50404 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SftpdP50404 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SftpdP50404 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SftpdP50404 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SftpdP50404 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SftpdP50404 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SftpdP50404 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SftpdP50404 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SftpdP50404 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SftpdP50404 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SftpdP50404 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms