Protein–RNA interactions for Protein: P49817

Cav1, Caveolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cav1P49817 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cav1P49817 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cav1P49817 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cav1P49817 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cav1P49817 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cav1P49817 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cav1P49817 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cav1P49817 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cav1P49817 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cav1P49817 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cav1P49817 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cav1P49817 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cav1P49817 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cav1P49817 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cav1P49817 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cav1P49817 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cav1P49817 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cav1P49817 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cav1P49817 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cav1P49817 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cav1P49817 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cav1P49817 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cav1P49817 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cav1P49817 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cav1P49817 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cav1P49817 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cav1P49817 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cav1P49817 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cav1P49817 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cav1P49817 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cav1P49817 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cav1P49817 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cav1P49817 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cav1P49817 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cav1P49817 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cav1P49817 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cav1P49817 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cav1P49817 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cav1P49817 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cav1P49817 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cav1P49817 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cav1P49817 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cav1P49817 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cav1P49817 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cav1P49817 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cav1P49817 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cav1P49817 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cav1P49817 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cav1P49817 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cav1P49817 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cav1P49817 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cav1P49817 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cav1P49817 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cav1P49817 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cav1P49817 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cav1P49817 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cav1P49817 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cav1P49817 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cav1P49817 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cav1P49817 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cav1P49817 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cav1P49817 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cav1P49817 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cav1P49817 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cav1P49817 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cav1P49817 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cav1P49817 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cav1P49817 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cav1P49817 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cav1P49817 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cav1P49817 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cav1P49817 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cav1P49817 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cav1P49817 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cav1P49817 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cav1P49817 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cav1P49817 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cav1P49817 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cav1P49817 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cav1P49817 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cav1P49817 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cav1P49817 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cav1P49817 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cav1P49817 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cav1P49817 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cav1P49817 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cav1P49817 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cav1P49817 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cav1P49817 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cav1P49817 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cav1P49817 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cav1P49817 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cav1P49817 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cav1P49817 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cav1P49817 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cav1P49817 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cav1P49817 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cav1P49817 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cav1P49817 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cav1P49817 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms