Protein–RNA interactions for Protein: P48787

Tnni3, Troponin I, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3P48787 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Tnni3P48787 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnni3P48787 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnni3P48787 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnni3P48787 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tnni3P48787 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnni3P48787 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnni3P48787 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnni3P48787 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnni3P48787 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnni3P48787 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnni3P48787 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnni3P48787 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnni3P48787 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnni3P48787 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnni3P48787 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnni3P48787 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnni3P48787 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnni3P48787 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnni3P48787 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnni3P48787 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnni3P48787 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnni3P48787 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnni3P48787 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnni3P48787 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnni3P48787 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnni3P48787 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnni3P48787 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnni3P48787 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnni3P48787 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnni3P48787 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnni3P48787 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnni3P48787 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnni3P48787 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnni3P48787 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnni3P48787 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnni3P48787 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnni3P48787 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnni3P48787 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnni3P48787 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnni3P48787 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnni3P48787 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnni3P48787 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnni3P48787 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnni3P48787 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnni3P48787 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnni3P48787 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnni3P48787 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnni3P48787 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnni3P48787 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnni3P48787 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnni3P48787 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnni3P48787 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnni3P48787 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnni3P48787 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnni3P48787 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnni3P48787 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnni3P48787 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnni3P48787 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnni3P48787 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnni3P48787 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnni3P48787 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnni3P48787 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnni3P48787 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnni3P48787 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnni3P48787 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnni3P48787 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnni3P48787 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnni3P48787 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnni3P48787 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnni3P48787 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnni3P48787 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnni3P48787 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnni3P48787 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnni3P48787 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnni3P48787 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnni3P48787 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnni3P48787 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnni3P48787 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnni3P48787 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnni3P48787 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnni3P48787 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnni3P48787 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnni3P48787 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnni3P48787 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnni3P48787 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnni3P48787 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnni3P48787 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnni3P48787 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnni3P48787 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnni3P48787 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnni3P48787 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnni3P48787 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnni3P48787 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnni3P48787 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnni3P48787 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnni3P48787 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnni3P48787 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnni3P48787 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnni3P48787 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms