Protein–RNA interactions for Protein: P48678

Lmna, Prelamin-A/C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LmnaP48678 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LmnaP48678 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LmnaP48678 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LmnaP48678 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LmnaP48678 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LmnaP48678 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LmnaP48678 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LmnaP48678 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LmnaP48678 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LmnaP48678 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LmnaP48678 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LmnaP48678 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LmnaP48678 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LmnaP48678 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LmnaP48678 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LmnaP48678 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LmnaP48678 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LmnaP48678 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LmnaP48678 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LmnaP48678 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LmnaP48678 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LmnaP48678 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LmnaP48678 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LmnaP48678 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LmnaP48678 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LmnaP48678 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LmnaP48678 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LmnaP48678 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LmnaP48678 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LmnaP48678 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LmnaP48678 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LmnaP48678 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LmnaP48678 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LmnaP48678 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LmnaP48678 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LmnaP48678 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LmnaP48678 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LmnaP48678 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LmnaP48678 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LmnaP48678 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LmnaP48678 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LmnaP48678 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LmnaP48678 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LmnaP48678 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LmnaP48678 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LmnaP48678 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LmnaP48678 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LmnaP48678 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LmnaP48678 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LmnaP48678 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LmnaP48678 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LmnaP48678 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LmnaP48678 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LmnaP48678 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LmnaP48678 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LmnaP48678 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LmnaP48678 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LmnaP48678 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LmnaP48678 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LmnaP48678 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LmnaP48678 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LmnaP48678 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LmnaP48678 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LmnaP48678 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LmnaP48678 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LmnaP48678 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LmnaP48678 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LmnaP48678 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LmnaP48678 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LmnaP48678 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LmnaP48678 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LmnaP48678 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LmnaP48678 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LmnaP48678 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LmnaP48678 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
LmnaP48678 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LmnaP48678 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LmnaP48678 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LmnaP48678 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LmnaP48678 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LmnaP48678 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LmnaP48678 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LmnaP48678 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LmnaP48678 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LmnaP48678 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LmnaP48678 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LmnaP48678 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LmnaP48678 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LmnaP48678 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LmnaP48678 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LmnaP48678 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LmnaP48678 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LmnaP48678 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LmnaP48678 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LmnaP48678 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LmnaP48678 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LmnaP48678 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LmnaP48678 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LmnaP48678 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LmnaP48678 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms