Protein–RNA interactions for Protein: P48193

Epb41, Protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41P48193 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Epb41P48193 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Epb41P48193 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Epb41P48193 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Epb41P48193 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Epb41P48193 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Epb41P48193 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Epb41P48193 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Epb41P48193 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Epb41P48193 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Epb41P48193 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Epb41P48193 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Epb41P48193 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Epb41P48193 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Epb41P48193 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Epb41P48193 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Epb41P48193 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Epb41P48193 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Epb41P48193 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Epb41P48193 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Epb41P48193 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Epb41P48193 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Epb41P48193 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Epb41P48193 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Epb41P48193 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Epb41P48193 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Epb41P48193 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Epb41P48193 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Epb41P48193 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Epb41P48193 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Epb41P48193 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Epb41P48193 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Epb41P48193 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Epb41P48193 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Epb41P48193 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Epb41P48193 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Epb41P48193 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Epb41P48193 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Epb41P48193 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Epb41P48193 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Epb41P48193 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Epb41P48193 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Epb41P48193 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Epb41P48193 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Epb41P48193 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Epb41P48193 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Epb41P48193 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Epb41P48193 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Epb41P48193 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Epb41P48193 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Epb41P48193 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Epb41P48193 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Epb41P48193 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Epb41P48193 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Epb41P48193 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Epb41P48193 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Epb41P48193 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Epb41P48193 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Epb41P48193 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Epb41P48193 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Epb41P48193 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Epb41P48193 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Epb41P48193 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Epb41P48193 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Epb41P48193 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Epb41P48193 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Epb41P48193 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Epb41P48193 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Epb41P48193 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Epb41P48193 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Epb41P48193 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Epb41P48193 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Epb41P48193 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Epb41P48193 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Epb41P48193 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Epb41P48193 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Epb41P48193 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Epb41P48193 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Epb41P48193 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Epb41P48193 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Epb41P48193 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Epb41P48193 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Epb41P48193 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Epb41P48193 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Epb41P48193 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Epb41P48193 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Epb41P48193 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Epb41P48193 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Epb41P48193 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Epb41P48193 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Epb41P48193 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Epb41P48193 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Epb41P48193 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Epb41P48193 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Epb41P48193 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Epb41P48193 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Epb41P48193 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Epb41P48193 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Epb41P48193 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Epb41P48193 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms