Protein–RNA interactions for Protein: P48031

Gbx2, Homeobox protein GBX-2, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx2P48031 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms