Protein–RNA interactions for Protein: P47878

Igfbp3, Insulin-like growth factor-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igfbp3P47878 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Igfbp3P47878 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Igfbp3P47878 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Igfbp3P47878 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Igfbp3P47878 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Igfbp3P47878 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Igfbp3P47878 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Igfbp3P47878 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Igfbp3P47878 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Igfbp3P47878 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Igfbp3P47878 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Igfbp3P47878 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Igfbp3P47878 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Igfbp3P47878 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Igfbp3P47878 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Igfbp3P47878 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Igfbp3P47878 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Igfbp3P47878 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Igfbp3P47878 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Igfbp3P47878 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Igfbp3P47878 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Igfbp3P47878 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Igfbp3P47878 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Igfbp3P47878 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Igfbp3P47878 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Igfbp3P47878 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Igfbp3P47878 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Igfbp3P47878 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Igfbp3P47878 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Igfbp3P47878 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Igfbp3P47878 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Igfbp3P47878 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Igfbp3P47878 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Igfbp3P47878 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Igfbp3P47878 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Igfbp3P47878 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Igfbp3P47878 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Igfbp3P47878 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Igfbp3P47878 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Igfbp3P47878 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Igfbp3P47878 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Igfbp3P47878 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Igfbp3P47878 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Igfbp3P47878 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Igfbp3P47878 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Igfbp3P47878 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Igfbp3P47878 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Igfbp3P47878 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Igfbp3P47878 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Igfbp3P47878 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Igfbp3P47878 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Igfbp3P47878 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Igfbp3P47878 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Igfbp3P47878 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Igfbp3P47878 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Igfbp3P47878 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Igfbp3P47878 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Igfbp3P47878 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Igfbp3P47878 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Igfbp3P47878 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Igfbp3P47878 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Igfbp3P47878 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Igfbp3P47878 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Igfbp3P47878 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Igfbp3P47878 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Igfbp3P47878 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Igfbp3P47878 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Igfbp3P47878 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Igfbp3P47878 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Igfbp3P47878 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Igfbp3P47878 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Igfbp3P47878 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Igfbp3P47878 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Igfbp3P47878 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Igfbp3P47878 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Igfbp3P47878 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Igfbp3P47878 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Igfbp3P47878 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Igfbp3P47878 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Igfbp3P47878 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Igfbp3P47878 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Igfbp3P47878 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Igfbp3P47878 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Igfbp3P47878 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Igfbp3P47878 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Igfbp3P47878 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Igfbp3P47878 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Igfbp3P47878 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Igfbp3P47878 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Igfbp3P47878 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Igfbp3P47878 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Igfbp3P47878 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Igfbp3P47878 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Igfbp3P47878 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Igfbp3P47878 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Igfbp3P47878 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Igfbp3P47878 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Igfbp3P47878 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Igfbp3P47878 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Igfbp3P47878 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms