Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SrprbP47758 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SrprbP47758 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SrprbP47758 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SrprbP47758 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SrprbP47758 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SrprbP47758 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SrprbP47758 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SrprbP47758 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SrprbP47758 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SrprbP47758 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SrprbP47758 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SrprbP47758 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SrprbP47758 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SrprbP47758 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SrprbP47758 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SrprbP47758 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SrprbP47758 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SrprbP47758 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SrprbP47758 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SrprbP47758 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SrprbP47758 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SrprbP47758 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SrprbP47758 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SrprbP47758 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SrprbP47758 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SrprbP47758 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SrprbP47758 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SrprbP47758 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SrprbP47758 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SrprbP47758 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SrprbP47758 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SrprbP47758 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SrprbP47758 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SrprbP47758 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SrprbP47758 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SrprbP47758 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SrprbP47758 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SrprbP47758 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SrprbP47758 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SrprbP47758 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SrprbP47758 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SrprbP47758 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SrprbP47758 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SrprbP47758 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SrprbP47758 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SrprbP47758 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SrprbP47758 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SrprbP47758 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SrprbP47758 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SrprbP47758 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SrprbP47758 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SrprbP47758 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SrprbP47758 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SrprbP47758 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SrprbP47758 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SrprbP47758 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SrprbP47758 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SrprbP47758 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SrprbP47758 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SrprbP47758 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SrprbP47758 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SrprbP47758 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SrprbP47758 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SrprbP47758 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SrprbP47758 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SrprbP47758 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SrprbP47758 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SrprbP47758 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SrprbP47758 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SrprbP47758 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SrprbP47758 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SrprbP47758 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SrprbP47758 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SrprbP47758 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SrprbP47758 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SrprbP47758 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SrprbP47758 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SrprbP47758 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SrprbP47758 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SrprbP47758 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SrprbP47758 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SrprbP47758 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SrprbP47758 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SrprbP47758 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SrprbP47758 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SrprbP47758 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SrprbP47758 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SrprbP47758 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SrprbP47758 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SrprbP47758 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SrprbP47758 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SrprbP47758 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SrprbP47758 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SrprbP47758 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SrprbP47758 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SrprbP47758 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SrprbP47758 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SrprbP47758 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SrprbP47758 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms