Protein–RNA interactions for Protein: P46735

Myo1b, Unconventional myosin-Ib, mousemouse

Predictions only

Length 1,107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo1bP46735 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Myo1bP46735 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Myo1bP46735 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Myo1bP46735 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Myo1bP46735 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Myo1bP46735 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Myo1bP46735 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Myo1bP46735 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Myo1bP46735 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Myo1bP46735 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Myo1bP46735 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Myo1bP46735 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Myo1bP46735 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Myo1bP46735 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Myo1bP46735 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Myo1bP46735 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Myo1bP46735 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Myo1bP46735 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Myo1bP46735 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Myo1bP46735 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Myo1bP46735 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Myo1bP46735 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Myo1bP46735 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Myo1bP46735 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Myo1bP46735 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Myo1bP46735 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Myo1bP46735 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Myo1bP46735 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Myo1bP46735 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Myo1bP46735 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Myo1bP46735 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Myo1bP46735 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Myo1bP46735 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Myo1bP46735 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Myo1bP46735 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Myo1bP46735 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Myo1bP46735 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Myo1bP46735 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Myo1bP46735 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Myo1bP46735 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Myo1bP46735 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Myo1bP46735 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Myo1bP46735 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Myo1bP46735 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Myo1bP46735 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Myo1bP46735 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Myo1bP46735 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Myo1bP46735 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Myo1bP46735 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Myo1bP46735 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Myo1bP46735 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Myo1bP46735 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Myo1bP46735 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Myo1bP46735 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Myo1bP46735 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Myo1bP46735 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Myo1bP46735 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Myo1bP46735 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Myo1bP46735 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Myo1bP46735 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Myo1bP46735 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Myo1bP46735 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Myo1bP46735 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Myo1bP46735 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Myo1bP46735 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Myo1bP46735 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Myo1bP46735 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Myo1bP46735 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Myo1bP46735 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Myo1bP46735 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Myo1bP46735 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Myo1bP46735 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Myo1bP46735 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Myo1bP46735 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Myo1bP46735 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Myo1bP46735 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Myo1bP46735 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Myo1bP46735 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Myo1bP46735 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Myo1bP46735 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Myo1bP46735 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Myo1bP46735 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Myo1bP46735 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Myo1bP46735 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Myo1bP46735 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Myo1bP46735 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Myo1bP46735 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Myo1bP46735 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Myo1bP46735 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Myo1bP46735 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Myo1bP46735 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Myo1bP46735 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Myo1bP46735 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Myo1bP46735 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Myo1bP46735 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Myo1bP46735 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Myo1bP46735 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Myo1bP46735 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Myo1bP46735 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Myo1bP46735 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms