Protein–RNA interactions for Protein: P46638

Rab11b, Ras-related protein Rab-11B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11bP46638 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab11bP46638 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms