Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cdkn1bP46414 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms