Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
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PtgfrP43117 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PtgfrP43117 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PtgfrP43117 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PtgfrP43117 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PtgfrP43117 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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PtgfrP43117 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PtgfrP43117 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PtgfrP43117 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PtgfrP43117 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtgfrP43117 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtgfrP43117 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtgfrP43117 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtgfrP43117 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtgfrP43117 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtgfrP43117 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtgfrP43117 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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PtgfrP43117 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtgfrP43117 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtgfrP43117 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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PtgfrP43117 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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PtgfrP43117 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtgfrP43117 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtgfrP43117 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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PtgfrP43117 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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PtgfrP43117 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtgfrP43117 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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PtgfrP43117 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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PtgfrP43117 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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PtgfrP43117 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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PtgfrP43117 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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PtgfrP43117 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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PtgfrP43117 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PtgfrP43117 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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PtgfrP43117 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
PtgfrP43117 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
PtgfrP43117 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
PtgfrP43117 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
PtgfrP43117 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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PtgfrP43117 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtgfrP43117 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtgfrP43117 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtgfrP43117 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtgfrP43117 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtgfrP43117 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtgfrP43117 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtgfrP43117 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtgfrP43117 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
PtgfrP43117 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtgfrP43117 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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PtgfrP43117 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms