Protein–RNA interactions for Protein: P39428

Traf1, TNF receptor-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf1P39428 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Traf1P39428 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Traf1P39428 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Traf1P39428 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Traf1P39428 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Traf1P39428 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Traf1P39428 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Traf1P39428 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Traf1P39428 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Traf1P39428 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Traf1P39428 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Traf1P39428 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Traf1P39428 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Traf1P39428 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Traf1P39428 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Traf1P39428 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Traf1P39428 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Traf1P39428 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Traf1P39428 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Traf1P39428 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Traf1P39428 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Traf1P39428 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Traf1P39428 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Traf1P39428 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Traf1P39428 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Traf1P39428 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Traf1P39428 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Traf1P39428 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Traf1P39428 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Traf1P39428 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Traf1P39428 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Traf1P39428 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Traf1P39428 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Traf1P39428 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Traf1P39428 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Traf1P39428 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Traf1P39428 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Traf1P39428 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Traf1P39428 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Traf1P39428 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Traf1P39428 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Traf1P39428 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Traf1P39428 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Traf1P39428 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Traf1P39428 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Traf1P39428 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Traf1P39428 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Traf1P39428 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Traf1P39428 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Traf1P39428 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Traf1P39428 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Traf1P39428 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Traf1P39428 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Traf1P39428 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Traf1P39428 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Traf1P39428 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Traf1P39428 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Traf1P39428 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Traf1P39428 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Traf1P39428 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Traf1P39428 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Traf1P39428 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Traf1P39428 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Traf1P39428 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Traf1P39428 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Traf1P39428 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Traf1P39428 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Traf1P39428 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Traf1P39428 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Traf1P39428 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Traf1P39428 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Traf1P39428 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Traf1P39428 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Traf1P39428 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Traf1P39428 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Traf1P39428 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Traf1P39428 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Traf1P39428 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Traf1P39428 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Traf1P39428 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Traf1P39428 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Traf1P39428 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Traf1P39428 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Traf1P39428 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Traf1P39428 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Traf1P39428 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Traf1P39428 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Traf1P39428 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Traf1P39428 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Traf1P39428 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Traf1P39428 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Traf1P39428 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Traf1P39428 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Traf1P39428 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Traf1P39428 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Traf1P39428 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Traf1P39428 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Traf1P39428 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Traf1P39428 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Traf1P39428 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms