Protein–RNA interactions for Protein: P37238

Pparg, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpargP37238 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PpargP37238 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PpargP37238 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PpargP37238 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PpargP37238 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PpargP37238 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PpargP37238 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PpargP37238 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PpargP37238 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PpargP37238 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PpargP37238 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PpargP37238 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PpargP37238 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PpargP37238 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PpargP37238 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PpargP37238 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PpargP37238 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PpargP37238 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PpargP37238 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PpargP37238 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PpargP37238 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PpargP37238 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PpargP37238 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PpargP37238 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PpargP37238 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PpargP37238 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PpargP37238 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PpargP37238 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PpargP37238 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PpargP37238 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PpargP37238 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PpargP37238 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PpargP37238 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PpargP37238 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PpargP37238 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PpargP37238 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PpargP37238 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PpargP37238 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PpargP37238 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PpargP37238 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PpargP37238 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PpargP37238 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PpargP37238 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PpargP37238 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PpargP37238 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PpargP37238 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PpargP37238 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PpargP37238 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PpargP37238 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PpargP37238 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PpargP37238 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PpargP37238 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PpargP37238 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PpargP37238 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PpargP37238 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PpargP37238 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PpargP37238 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PpargP37238 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PpargP37238 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PpargP37238 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PpargP37238 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PpargP37238 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PpargP37238 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PpargP37238 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PpargP37238 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PpargP37238 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PpargP37238 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PpargP37238 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PpargP37238 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PpargP37238 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PpargP37238 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PpargP37238 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
PpargP37238 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PpargP37238 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PpargP37238 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PpargP37238 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PpargP37238 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PpargP37238 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PpargP37238 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PpargP37238 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PpargP37238 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PpargP37238 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PpargP37238 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PpargP37238 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PpargP37238 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PpargP37238 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PpargP37238 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PpargP37238 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PpargP37238 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PpargP37238 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PpargP37238 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
PpargP37238 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PpargP37238 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PpargP37238 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PpargP37238 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PpargP37238 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PpargP37238 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PpargP37238 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PpargP37238 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PpargP37238 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms