Protein–RNA interactions for Protein: P36536

Sar1a, GTP-binding protein SAR1a, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sar1aP36536 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sar1aP36536 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sar1aP36536 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sar1aP36536 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sar1aP36536 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sar1aP36536 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sar1aP36536 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sar1aP36536 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sar1aP36536 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sar1aP36536 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sar1aP36536 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sar1aP36536 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sar1aP36536 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sar1aP36536 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sar1aP36536 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sar1aP36536 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sar1aP36536 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sar1aP36536 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sar1aP36536 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sar1aP36536 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sar1aP36536 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sar1aP36536 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sar1aP36536 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sar1aP36536 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sar1aP36536 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sar1aP36536 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sar1aP36536 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sar1aP36536 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sar1aP36536 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sar1aP36536 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sar1aP36536 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sar1aP36536 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sar1aP36536 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sar1aP36536 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sar1aP36536 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sar1aP36536 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sar1aP36536 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sar1aP36536 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sar1aP36536 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sar1aP36536 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sar1aP36536 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sar1aP36536 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sar1aP36536 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sar1aP36536 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sar1aP36536 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sar1aP36536 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sar1aP36536 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sar1aP36536 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sar1aP36536 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sar1aP36536 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sar1aP36536 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sar1aP36536 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sar1aP36536 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sar1aP36536 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sar1aP36536 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sar1aP36536 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sar1aP36536 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sar1aP36536 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sar1aP36536 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Sar1aP36536 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sar1aP36536 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sar1aP36536 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sar1aP36536 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sar1aP36536 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sar1aP36536 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sar1aP36536 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sar1aP36536 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sar1aP36536 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sar1aP36536 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sar1aP36536 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sar1aP36536 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sar1aP36536 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sar1aP36536 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sar1aP36536 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sar1aP36536 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sar1aP36536 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sar1aP36536 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sar1aP36536 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sar1aP36536 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sar1aP36536 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sar1aP36536 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sar1aP36536 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sar1aP36536 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sar1aP36536 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sar1aP36536 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sar1aP36536 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sar1aP36536 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sar1aP36536 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sar1aP36536 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sar1aP36536 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sar1aP36536 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sar1aP36536 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sar1aP36536 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sar1aP36536 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sar1aP36536 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sar1aP36536 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sar1aP36536 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sar1aP36536 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sar1aP36536 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sar1aP36536 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms