Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nedd1P33215 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nedd1P33215 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nedd1P33215 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nedd1P33215 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nedd1P33215 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nedd1P33215 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nedd1P33215 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nedd1P33215 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nedd1P33215 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nedd1P33215 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nedd1P33215 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nedd1P33215 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nedd1P33215 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Nedd1P33215 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nedd1P33215 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nedd1P33215 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nedd1P33215 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nedd1P33215 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nedd1P33215 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nedd1P33215 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nedd1P33215 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nedd1P33215 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nedd1P33215 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nedd1P33215 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nedd1P33215 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nedd1P33215 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nedd1P33215 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Nedd1P33215 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nedd1P33215 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nedd1P33215 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nedd1P33215 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nedd1P33215 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nedd1P33215 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nedd1P33215 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nedd1P33215 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nedd1P33215 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nedd1P33215 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nedd1P33215 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nedd1P33215 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nedd1P33215 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nedd1P33215 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nedd1P33215 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nedd1P33215 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nedd1P33215 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nedd1P33215 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nedd1P33215 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nedd1P33215 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nedd1P33215 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Nedd1P33215 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nedd1P33215 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nedd1P33215 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nedd1P33215 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nedd1P33215 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nedd1P33215 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nedd1P33215 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nedd1P33215 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nedd1P33215 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nedd1P33215 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nedd1P33215 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Nedd1P33215 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nedd1P33215 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nedd1P33215 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nedd1P33215 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nedd1P33215 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nedd1P33215 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nedd1P33215 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nedd1P33215 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Nedd1P33215 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nedd1P33215 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nedd1P33215 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nedd1P33215 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nedd1P33215 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Nedd1P33215 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nedd1P33215 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nedd1P33215 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Nedd1P33215 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nedd1P33215 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nedd1P33215 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nedd1P33215 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nedd1P33215 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nedd1P33215 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nedd1P33215 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nedd1P33215 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nedd1P33215 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nedd1P33215 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nedd1P33215 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nedd1P33215 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nedd1P33215 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nedd1P33215 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nedd1P33215 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nedd1P33215 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nedd1P33215 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nedd1P33215 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nedd1P33215 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nedd1P33215 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nedd1P33215 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nedd1P33215 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nedd1P33215 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nedd1P33215 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms