Protein–RNA interactions for Protein: P30204

Msr1, Macrophage scavenger receptor types I and II, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msr1P30204 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Msr1P30204 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Msr1P30204 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Msr1P30204 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Msr1P30204 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Msr1P30204 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Msr1P30204 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Msr1P30204 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Msr1P30204 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Msr1P30204 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Msr1P30204 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Msr1P30204 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Msr1P30204 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Msr1P30204 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Msr1P30204 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Msr1P30204 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Msr1P30204 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Msr1P30204 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Msr1P30204 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Msr1P30204 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Msr1P30204 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Msr1P30204 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Msr1P30204 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Msr1P30204 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Msr1P30204 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Msr1P30204 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Msr1P30204 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Msr1P30204 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Msr1P30204 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Msr1P30204 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Msr1P30204 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Msr1P30204 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Msr1P30204 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Msr1P30204 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Msr1P30204 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Msr1P30204 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Msr1P30204 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Msr1P30204 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Msr1P30204 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Msr1P30204 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Msr1P30204 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Msr1P30204 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Msr1P30204 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Msr1P30204 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Msr1P30204 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Msr1P30204 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Msr1P30204 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Msr1P30204 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Msr1P30204 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Msr1P30204 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Msr1P30204 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Msr1P30204 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Msr1P30204 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Msr1P30204 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Msr1P30204 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Msr1P30204 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Msr1P30204 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Msr1P30204 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Msr1P30204 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Msr1P30204 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Msr1P30204 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Msr1P30204 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Msr1P30204 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Msr1P30204 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Msr1P30204 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Msr1P30204 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Msr1P30204 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Msr1P30204 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Msr1P30204 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Msr1P30204 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Msr1P30204 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Msr1P30204 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Msr1P30204 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Msr1P30204 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Msr1P30204 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Msr1P30204 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Msr1P30204 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Msr1P30204 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Msr1P30204 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Msr1P30204 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Msr1P30204 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Msr1P30204 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Msr1P30204 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Msr1P30204 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Msr1P30204 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Msr1P30204 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Msr1P30204 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Msr1P30204 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Msr1P30204 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Msr1P30204 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Msr1P30204 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Msr1P30204 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Msr1P30204 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Msr1P30204 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Msr1P30204 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Msr1P30204 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Msr1P30204 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Msr1P30204 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Msr1P30204 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Msr1P30204 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms