Protein–RNA interactions for Protein: P28867

Prkcd, Protein kinase C delta type, mousemouse

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcdP28867 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrkcdP28867 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkcdP28867 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkcdP28867 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkcdP28867 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkcdP28867 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkcdP28867 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkcdP28867 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkcdP28867 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkcdP28867 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkcdP28867 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkcdP28867 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkcdP28867 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkcdP28867 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkcdP28867 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkcdP28867 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkcdP28867 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkcdP28867 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkcdP28867 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkcdP28867 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkcdP28867 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkcdP28867 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkcdP28867 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkcdP28867 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkcdP28867 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkcdP28867 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkcdP28867 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkcdP28867 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkcdP28867 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkcdP28867 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkcdP28867 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkcdP28867 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkcdP28867 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkcdP28867 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
PrkcdP28867 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkcdP28867 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkcdP28867 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkcdP28867 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkcdP28867 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkcdP28867 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkcdP28867 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkcdP28867 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkcdP28867 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkcdP28867 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkcdP28867 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkcdP28867 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkcdP28867 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkcdP28867 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkcdP28867 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkcdP28867 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkcdP28867 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkcdP28867 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkcdP28867 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkcdP28867 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkcdP28867 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkcdP28867 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkcdP28867 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkcdP28867 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkcdP28867 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkcdP28867 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkcdP28867 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkcdP28867 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkcdP28867 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkcdP28867 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkcdP28867 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkcdP28867 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkcdP28867 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkcdP28867 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkcdP28867 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkcdP28867 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkcdP28867 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkcdP28867 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkcdP28867 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkcdP28867 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkcdP28867 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkcdP28867 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkcdP28867 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkcdP28867 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkcdP28867 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkcdP28867 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkcdP28867 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkcdP28867 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkcdP28867 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkcdP28867 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkcdP28867 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkcdP28867 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkcdP28867 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkcdP28867 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkcdP28867 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkcdP28867 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkcdP28867 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkcdP28867 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkcdP28867 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkcdP28867 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkcdP28867 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkcdP28867 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkcdP28867 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkcdP28867 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkcdP28867 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkcdP28867 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms