Protein–RNA interactions for Protein: P28704

Rxrb, Retinoic acid receptor RXR-beta, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrbP28704 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RxrbP28704 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RxrbP28704 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RxrbP28704 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RxrbP28704 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RxrbP28704 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RxrbP28704 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RxrbP28704 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RxrbP28704 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RxrbP28704 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RxrbP28704 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RxrbP28704 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RxrbP28704 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RxrbP28704 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RxrbP28704 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RxrbP28704 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RxrbP28704 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RxrbP28704 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RxrbP28704 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RxrbP28704 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RxrbP28704 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RxrbP28704 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RxrbP28704 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RxrbP28704 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RxrbP28704 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RxrbP28704 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RxrbP28704 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RxrbP28704 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RxrbP28704 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RxrbP28704 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RxrbP28704 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RxrbP28704 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RxrbP28704 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RxrbP28704 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RxrbP28704 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RxrbP28704 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RxrbP28704 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RxrbP28704 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RxrbP28704 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RxrbP28704 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RxrbP28704 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RxrbP28704 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RxrbP28704 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RxrbP28704 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RxrbP28704 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RxrbP28704 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RxrbP28704 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RxrbP28704 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RxrbP28704 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RxrbP28704 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RxrbP28704 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RxrbP28704 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RxrbP28704 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RxrbP28704 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RxrbP28704 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RxrbP28704 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RxrbP28704 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RxrbP28704 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RxrbP28704 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RxrbP28704 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RxrbP28704 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RxrbP28704 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RxrbP28704 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RxrbP28704 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RxrbP28704 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RxrbP28704 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RxrbP28704 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RxrbP28704 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RxrbP28704 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RxrbP28704 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RxrbP28704 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RxrbP28704 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RxrbP28704 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RxrbP28704 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RxrbP28704 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RxrbP28704 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RxrbP28704 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RxrbP28704 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RxrbP28704 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RxrbP28704 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RxrbP28704 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RxrbP28704 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RxrbP28704 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
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