Protein–RNA interactions for Protein: P28310

Defa3, Alpha-defensin 3, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa3P28310 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Defa3P28310 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Defa3P28310 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Defa3P28310 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Defa3P28310 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Defa3P28310 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Defa3P28310 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Defa3P28310 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Defa3P28310 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Defa3P28310 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Defa3P28310 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Defa3P28310 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Defa3P28310 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Defa3P28310 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Defa3P28310 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Defa3P28310 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Defa3P28310 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Defa3P28310 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Defa3P28310 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Defa3P28310 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Defa3P28310 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Defa3P28310 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Defa3P28310 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Defa3P28310 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Defa3P28310 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Defa3P28310 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Defa3P28310 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Defa3P28310 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Defa3P28310 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Defa3P28310 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Defa3P28310 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Defa3P28310 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Defa3P28310 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Defa3P28310 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Defa3P28310 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Defa3P28310 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Defa3P28310 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Defa3P28310 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Defa3P28310 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Defa3P28310 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Defa3P28310 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Defa3P28310 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Defa3P28310 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Defa3P28310 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Defa3P28310 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Defa3P28310 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Defa3P28310 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Defa3P28310 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Defa3P28310 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms