Protein–RNA interactions for Protein: P28301

Lox, Protein-lysine 6-oxidase, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LoxP28301 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LoxP28301 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LoxP28301 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LoxP28301 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LoxP28301 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LoxP28301 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LoxP28301 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LoxP28301 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LoxP28301 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LoxP28301 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LoxP28301 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LoxP28301 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LoxP28301 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LoxP28301 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
LoxP28301 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LoxP28301 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LoxP28301 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LoxP28301 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LoxP28301 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LoxP28301 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LoxP28301 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LoxP28301 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LoxP28301 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LoxP28301 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
LoxP28301 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
LoxP28301 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LoxP28301 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LoxP28301 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LoxP28301 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LoxP28301 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LoxP28301 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LoxP28301 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LoxP28301 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LoxP28301 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LoxP28301 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LoxP28301 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LoxP28301 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LoxP28301 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LoxP28301 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LoxP28301 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LoxP28301 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LoxP28301 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LoxP28301 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LoxP28301 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LoxP28301 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LoxP28301 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LoxP28301 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LoxP28301 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LoxP28301 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LoxP28301 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LoxP28301 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
LoxP28301 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
LoxP28301 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LoxP28301 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LoxP28301 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
LoxP28301 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
LoxP28301 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LoxP28301 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LoxP28301 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LoxP28301 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LoxP28301 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LoxP28301 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LoxP28301 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LoxP28301 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LoxP28301 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LoxP28301 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LoxP28301 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LoxP28301 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LoxP28301 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LoxP28301 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LoxP28301 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LoxP28301 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LoxP28301 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LoxP28301 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LoxP28301 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LoxP28301 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LoxP28301 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LoxP28301 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LoxP28301 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LoxP28301 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LoxP28301 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LoxP28301 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LoxP28301 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LoxP28301 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
LoxP28301 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LoxP28301 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LoxP28301 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LoxP28301 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LoxP28301 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LoxP28301 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LoxP28301 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LoxP28301 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LoxP28301 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LoxP28301 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LoxP28301 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LoxP28301 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LoxP28301 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LoxP28301 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LoxP28301 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LoxP28301 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms