Protein–RNA interactions for Protein: P28231

Gjb3, Gap junction beta-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb3P28231 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gjb3P28231 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms