Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gjb1P28230 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gjb1P28230 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gjb1P28230 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gjb1P28230 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gjb1P28230 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gjb1P28230 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gjb1P28230 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gjb1P28230 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gjb1P28230 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gjb1P28230 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gjb1P28230 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Gjb1P28230 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gjb1P28230 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gjb1P28230 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gjb1P28230 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gjb1P28230 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gjb1P28230 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gjb1P28230 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gjb1P28230 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Gjb1P28230 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gjb1P28230 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gjb1P28230 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Gjb1P28230 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Gjb1P28230 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gjb1P28230 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gjb1P28230 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gjb1P28230 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gjb1P28230 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gjb1P28230 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gjb1P28230 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gjb1P28230 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gjb1P28230 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gjb1P28230 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gjb1P28230 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gjb1P28230 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gjb1P28230 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gjb1P28230 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gjb1P28230 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gjb1P28230 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gjb1P28230 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Gjb1P28230 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gjb1P28230 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gjb1P28230 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gjb1P28230 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gjb1P28230 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gjb1P28230 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gjb1P28230 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gjb1P28230 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gjb1P28230 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gjb1P28230 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gjb1P28230 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gjb1P28230 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gjb1P28230 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gjb1P28230 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gjb1P28230 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gjb1P28230 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gjb1P28230 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gjb1P28230 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gjb1P28230 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gjb1P28230 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gjb1P28230 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gjb1P28230 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gjb1P28230 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gjb1P28230 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Gjb1P28230 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gjb1P28230 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Gjb1P28230 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gjb1P28230 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gjb1P28230 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gjb1P28230 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gjb1P28230 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gjb1P28230 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gjb1P28230 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gjb1P28230 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gjb1P28230 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gjb1P28230 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gjb1P28230 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gjb1P28230 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Gjb1P28230 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gjb1P28230 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gjb1P28230 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gjb1P28230 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gjb1P28230 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gjb1P28230 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gjb1P28230 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gjb1P28230 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gjb1P28230 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gjb1P28230 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gjb1P28230 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gjb1P28230 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gjb1P28230 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Gjb1P28230 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gjb1P28230 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gjb1P28230 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gjb1P28230 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gjb1P28230 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gjb1P28230 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gjb1P28230 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gjb1P28230 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms