Protein–RNA interactions for Protein: P25801

Lmo2, Rhombotin-2, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo2P25801 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmo2P25801 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmo2P25801 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmo2P25801 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmo2P25801 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmo2P25801 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmo2P25801 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmo2P25801 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmo2P25801 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmo2P25801 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmo2P25801 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmo2P25801 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmo2P25801 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmo2P25801 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmo2P25801 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmo2P25801 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmo2P25801 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmo2P25801 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmo2P25801 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmo2P25801 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmo2P25801 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmo2P25801 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmo2P25801 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmo2P25801 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmo2P25801 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmo2P25801 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmo2P25801 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmo2P25801 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmo2P25801 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmo2P25801 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmo2P25801 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmo2P25801 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmo2P25801 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmo2P25801 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmo2P25801 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmo2P25801 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmo2P25801 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmo2P25801 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmo2P25801 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmo2P25801 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmo2P25801 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmo2P25801 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmo2P25801 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmo2P25801 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmo2P25801 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmo2P25801 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmo2P25801 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmo2P25801 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmo2P25801 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmo2P25801 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmo2P25801 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmo2P25801 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmo2P25801 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmo2P25801 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmo2P25801 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmo2P25801 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmo2P25801 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmo2P25801 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmo2P25801 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmo2P25801 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmo2P25801 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmo2P25801 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmo2P25801 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmo2P25801 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmo2P25801 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmo2P25801 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmo2P25801 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmo2P25801 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmo2P25801 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmo2P25801 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmo2P25801 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmo2P25801 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmo2P25801 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmo2P25801 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmo2P25801 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmo2P25801 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmo2P25801 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmo2P25801 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmo2P25801 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmo2P25801 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmo2P25801 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmo2P25801 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmo2P25801 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmo2P25801 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmo2P25801 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmo2P25801 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmo2P25801 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmo2P25801 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmo2P25801 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmo2P25801 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmo2P25801 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmo2P25801 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmo2P25801 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmo2P25801 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmo2P25801 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmo2P25801 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmo2P25801 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmo2P25801 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmo2P25801 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmo2P25801 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms