Protein–RNA interactions for Protein: P25799

Nfkb1, Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 971 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfkb1P25799 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nfkb1P25799 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nfkb1P25799 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nfkb1P25799 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nfkb1P25799 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nfkb1P25799 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nfkb1P25799 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nfkb1P25799 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nfkb1P25799 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nfkb1P25799 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nfkb1P25799 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nfkb1P25799 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nfkb1P25799 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nfkb1P25799 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nfkb1P25799 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nfkb1P25799 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nfkb1P25799 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nfkb1P25799 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nfkb1P25799 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nfkb1P25799 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nfkb1P25799 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nfkb1P25799 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nfkb1P25799 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nfkb1P25799 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nfkb1P25799 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nfkb1P25799 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nfkb1P25799 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nfkb1P25799 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nfkb1P25799 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nfkb1P25799 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nfkb1P25799 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nfkb1P25799 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nfkb1P25799 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nfkb1P25799 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nfkb1P25799 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nfkb1P25799 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nfkb1P25799 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nfkb1P25799 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nfkb1P25799 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nfkb1P25799 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nfkb1P25799 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nfkb1P25799 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nfkb1P25799 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nfkb1P25799 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nfkb1P25799 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nfkb1P25799 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nfkb1P25799 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nfkb1P25799 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nfkb1P25799 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nfkb1P25799 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nfkb1P25799 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nfkb1P25799 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nfkb1P25799 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nfkb1P25799 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nfkb1P25799 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nfkb1P25799 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nfkb1P25799 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nfkb1P25799 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nfkb1P25799 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nfkb1P25799 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nfkb1P25799 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nfkb1P25799 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nfkb1P25799 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nfkb1P25799 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nfkb1P25799 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nfkb1P25799 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nfkb1P25799 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nfkb1P25799 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nfkb1P25799 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nfkb1P25799 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nfkb1P25799 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nfkb1P25799 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nfkb1P25799 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nfkb1P25799 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nfkb1P25799 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nfkb1P25799 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nfkb1P25799 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nfkb1P25799 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nfkb1P25799 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nfkb1P25799 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nfkb1P25799 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nfkb1P25799 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nfkb1P25799 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nfkb1P25799 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nfkb1P25799 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nfkb1P25799 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nfkb1P25799 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nfkb1P25799 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nfkb1P25799 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nfkb1P25799 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nfkb1P25799 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nfkb1P25799 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nfkb1P25799 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nfkb1P25799 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nfkb1P25799 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nfkb1P25799 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nfkb1P25799 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nfkb1P25799 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nfkb1P25799 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nfkb1P25799 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms