Protein–RNA interactions for Protein: P25322

Ccnd1, G1/S-specific cyclin-D1, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd1P25322 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms