Protein–RNA interactions for Protein: P24161

Cd247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, mousemouse

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd247P24161 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd247P24161 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd247P24161 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd247P24161 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd247P24161 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd247P24161 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd247P24161 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd247P24161 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd247P24161 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd247P24161 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd247P24161 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd247P24161 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd247P24161 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd247P24161 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd247P24161 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd247P24161 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd247P24161 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd247P24161 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd247P24161 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd247P24161 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd247P24161 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd247P24161 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd247P24161 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd247P24161 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd247P24161 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd247P24161 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd247P24161 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd247P24161 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd247P24161 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd247P24161 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd247P24161 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd247P24161 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd247P24161 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd247P24161 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd247P24161 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd247P24161 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd247P24161 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd247P24161 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd247P24161 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd247P24161 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd247P24161 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd247P24161 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd247P24161 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd247P24161 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd247P24161 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd247P24161 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd247P24161 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd247P24161 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd247P24161 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd247P24161 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd247P24161 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd247P24161 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd247P24161 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd247P24161 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd247P24161 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd247P24161 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd247P24161 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd247P24161 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd247P24161 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd247P24161 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd247P24161 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd247P24161 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd247P24161 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd247P24161 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd247P24161 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd247P24161 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd247P24161 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd247P24161 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd247P24161 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd247P24161 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd247P24161 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd247P24161 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd247P24161 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd247P24161 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd247P24161 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd247P24161 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd247P24161 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd247P24161 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd247P24161 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd247P24161 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd247P24161 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd247P24161 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd247P24161 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd247P24161 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd247P24161 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd247P24161 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd247P24161 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd247P24161 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd247P24161 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd247P24161 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd247P24161 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd247P24161 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd247P24161 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd247P24161 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd247P24161 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd247P24161 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd247P24161 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd247P24161 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd247P24161 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd247P24161 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms