Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxd11P23813 Gm23426-201ENSMUST00000122483 318 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxd11P23813 Gm22817-201ENSMUST00000157448 356 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxd11P23813 Gm24498-201ENSMUST00000158445 102 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxd11P23813 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxd11P23813 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxd11P23813 1700052I22Rik-201ENSMUST00000190431 379 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxd11P23813 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxd11P23813 Gm44865-201ENSMUST00000207240 531 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxd11P23813 AC121960.3-201ENSMUST00000227077 623 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxd11P23813 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxd11P23813 Fpr3-201ENSMUST00000054871 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxd11P23813 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxd11P23813 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxd11P23813 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxd11P23813 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxd11P23813 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxd11P23813 Lrriq3-203ENSMUST00000194376 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxd11P23813 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxd11P23813 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxd11P23813 Nsa2-ps2-201ENSMUST00000120785 773 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Hoxd11P23813 Gm6451-201ENSMUST00000121488 717 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Hoxd11P23813 Milr1-203ENSMUST00000147326 1234 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxd11P23813 Clec2i-204ENSMUST00000160867 933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxd11P23813 Clec2i-205ENSMUST00000162666 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxd11P23813 Gm26550-201ENSMUST00000180699 1184 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxd11P23813 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxd11P23813 Scgb1b25-ps-201ENSMUST00000186419 415 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Hoxd11P23813 1700010J16Rik-202ENSMUST00000189116 890 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxd11P23813 Gm44673-201ENSMUST00000205692 996 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Hoxd11P23813 Mrpl42-202ENSMUST00000217777 455 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxd11P23813 AC153974.1-202ENSMUST00000218700 678 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxd11P23813 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Hoxd11P23813 Clec2i-201ENSMUST00000032519 1014 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxd11P23813 1810053B23Rik-205ENSMUST00000188056 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxd11P23813 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxd11P23813 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxd11P23813 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxd11P23813 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxd11P23813 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxd11P23813 Olfr353-202ENSMUST00000215925 1615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxd11P23813 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxd11P23813 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxd11P23813 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxd11P23813 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxd11P23813 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxd11P23813 Gm14065-201ENSMUST00000120848 585 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxd11P23813 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxd11P23813 Gm15600-201ENSMUST00000153522 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxd11P23813 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxd11P23813 Gm17059-201ENSMUST00000168284 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxd11P23813 Vmn1r25-201ENSMUST00000176572 1101 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxd11P23813 Gm21756-201ENSMUST00000178380 930 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxd11P23813 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxd11P23813 Gm45889-201ENSMUST00000209535 1057 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxd11P23813 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxd11P23813 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxd11P23813 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxd11P23813 Fam186a-201ENSMUST00000062631 759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxd11P23813 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxd11P23813 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxd11P23813 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxd11P23813 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxd11P23813 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxd11P23813 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxd11P23813 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxd11P23813 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxd11P23813 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxd11P23813 Gm12731-201ENSMUST00000120932 268 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxd11P23813 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxd11P23813 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxd11P23813 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxd11P23813 Vmn1r-ps53-201ENSMUST00000173066 922 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxd11P23813 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxd11P23813 Krtap6-3-202ENSMUST00000185581 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxd11P23813 Gm28811-201ENSMUST00000190650 442 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxd11P23813 Gm37808-201ENSMUST00000192038 442 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxd11P23813 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxd11P23813 Gm44392-201ENSMUST00000196758 115 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxd11P23813 4930401A07Rik-201ENSMUST00000214657 746 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxd11P23813 4930545L08Rik-201ENSMUST00000215688 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxd11P23813 Gm40418-201ENSMUST00000218806 1013 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxd11P23813 AC121542.1-201ENSMUST00000227245 721 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxd11P23813 AC080021.1-201ENSMUST00000228104 700 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxd11P23813 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxd11P23813 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxd11P23813 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxd11P23813 Krtap6-3-201ENSMUST00000079151 444 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxd11P23813 Vmn1r199-201ENSMUST00000091732 1104 ntAPPRIS P2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxd11P23813 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxd11P23813 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxd11P23813 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxd11P23813 Gm3755-201ENSMUST00000169555 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxd11P23813 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxd11P23813 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxd11P23813 Gm12874-201ENSMUST00000117190 913 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxd11P23813 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxd11P23813 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxd11P23813 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxd11P23813 Gm2058-201ENSMUST00000178791 560 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms