Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxd8P23463 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxd8P23463 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxd8P23463 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxd8P23463 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxd8P23463 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxd8P23463 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxd8P23463 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxd8P23463 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxd8P23463 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxd8P23463 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxd8P23463 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxd8P23463 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxd8P23463 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxd8P23463 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxd8P23463 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxd8P23463 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxd8P23463 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxd8P23463 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxd8P23463 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxd8P23463 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxd8P23463 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxd8P23463 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxd8P23463 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxd8P23463 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxd8P23463 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxd8P23463 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxd8P23463 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxd8P23463 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxd8P23463 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxd8P23463 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxd8P23463 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxd8P23463 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxd8P23463 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxd8P23463 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxd8P23463 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxd8P23463 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxd8P23463 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxd8P23463 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxd8P23463 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxd8P23463 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxd8P23463 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxd8P23463 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxd8P23463 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxd8P23463 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxd8P23463 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxd8P23463 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxd8P23463 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxd8P23463 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxd8P23463 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxd8P23463 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxd8P23463 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxd8P23463 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxd8P23463 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxd8P23463 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxd8P23463 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxd8P23463 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxd8P23463 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxd8P23463 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxd8P23463 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxd8P23463 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxd8P23463 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxd8P23463 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxd8P23463 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxd8P23463 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxd8P23463 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxd8P23463 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxd8P23463 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxd8P23463 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxd8P23463 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxd8P23463 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxd8P23463 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxd8P23463 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxd8P23463 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxd8P23463 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxd8P23463 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxd8P23463 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxd8P23463 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxd8P23463 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxd8P23463 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxd8P23463 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxd8P23463 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxd8P23463 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxd8P23463 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxd8P23463 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxd8P23463 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxd8P23463 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxd8P23463 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxd8P23463 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxd8P23463 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxd8P23463 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxd8P23463 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxd8P23463 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxd8P23463 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxd8P23463 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxd8P23463 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxd8P23463 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxd8P23463 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxd8P23463 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxd8P23463 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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