Protein–RNA interactions for Protein: P20615

Hoxb9, Homeobox protein Hox-B9, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb9P20615 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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