Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PdgfaP20033 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
PdgfaP20033 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PdgfaP20033 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PdgfaP20033 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PdgfaP20033 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PdgfaP20033 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PdgfaP20033 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PdgfaP20033 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PdgfaP20033 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PdgfaP20033 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PdgfaP20033 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PdgfaP20033 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PdgfaP20033 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PdgfaP20033 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PdgfaP20033 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PdgfaP20033 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PdgfaP20033 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PdgfaP20033 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PdgfaP20033 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PdgfaP20033 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PdgfaP20033 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PdgfaP20033 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PdgfaP20033 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PdgfaP20033 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PdgfaP20033 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PdgfaP20033 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PdgfaP20033 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PdgfaP20033 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PdgfaP20033 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PdgfaP20033 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PdgfaP20033 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PdgfaP20033 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PdgfaP20033 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PdgfaP20033 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PdgfaP20033 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PdgfaP20033 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PdgfaP20033 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PdgfaP20033 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PdgfaP20033 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PdgfaP20033 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PdgfaP20033 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PdgfaP20033 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PdgfaP20033 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PdgfaP20033 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PdgfaP20033 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PdgfaP20033 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PdgfaP20033 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PdgfaP20033 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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