Protein–RNA interactions for Protein: P18528

Ig heavy chain V region 6.96, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18528 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
P18528 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
P18528 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
P18528 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
P18528 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
P18528 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
P18528 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
P18528 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
P18528 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
P18528 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
P18528 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
P18528 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
P18528 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
P18528 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
P18528 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
P18528 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
P18528 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
P18528 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
P18528 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
P18528 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
P18528 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
P18528 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
P18528 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
P18528 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
P18528 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
P18528 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
P18528 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
P18528 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
P18528 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
P18528 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
P18528 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
P18528 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
P18528 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
P18528 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
P18528 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
P18528 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
P18528 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
P18528 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
P18528 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
P18528 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
P18528 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
P18528 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
P18528 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
P18528 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
P18528 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
P18528 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
P18528 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
P18528 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
P18528 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
P18528 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
P18528 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
P18528 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
P18528 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
P18528 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
P18528 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
P18528 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
P18528 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
P18528 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
P18528 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
P18528 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
P18528 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
P18528 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
P18528 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
P18528 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
P18528 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
P18528 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
P18528 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
P18528 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
P18528 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
P18528 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
P18528 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
P18528 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
P18528 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
P18528 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
P18528 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
P18528 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
P18528 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
P18528 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
P18528 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
P18528 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
P18528 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
P18528 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
P18528 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
P18528 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
P18528 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
P18528 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
P18528 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
P18528 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
P18528 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
P18528 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
P18528 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
P18528 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
P18528 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
P18528 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
P18528 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
P18528 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
P18528 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
P18528 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
P18528 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
P18528 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms