Protein–RNA interactions for Protein: P18406

Cyr61, Protein CYR61, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyr61P18406 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyr61P18406 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyr61P18406 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyr61P18406 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyr61P18406 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyr61P18406 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyr61P18406 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyr61P18406 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyr61P18406 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyr61P18406 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyr61P18406 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyr61P18406 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyr61P18406 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyr61P18406 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyr61P18406 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyr61P18406 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyr61P18406 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyr61P18406 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyr61P18406 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyr61P18406 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyr61P18406 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyr61P18406 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyr61P18406 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyr61P18406 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyr61P18406 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyr61P18406 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyr61P18406 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyr61P18406 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyr61P18406 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyr61P18406 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyr61P18406 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyr61P18406 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyr61P18406 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyr61P18406 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyr61P18406 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyr61P18406 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyr61P18406 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyr61P18406 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyr61P18406 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyr61P18406 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyr61P18406 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyr61P18406 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyr61P18406 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyr61P18406 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyr61P18406 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyr61P18406 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyr61P18406 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyr61P18406 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyr61P18406 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyr61P18406 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyr61P18406 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyr61P18406 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyr61P18406 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyr61P18406 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyr61P18406 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyr61P18406 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyr61P18406 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyr61P18406 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyr61P18406 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyr61P18406 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyr61P18406 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyr61P18406 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyr61P18406 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyr61P18406 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyr61P18406 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyr61P18406 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyr61P18406 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyr61P18406 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyr61P18406 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyr61P18406 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyr61P18406 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyr61P18406 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyr61P18406 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyr61P18406 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyr61P18406 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyr61P18406 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyr61P18406 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyr61P18406 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyr61P18406 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyr61P18406 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyr61P18406 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyr61P18406 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyr61P18406 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyr61P18406 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyr61P18406 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyr61P18406 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyr61P18406 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyr61P18406 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyr61P18406 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyr61P18406 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyr61P18406 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyr61P18406 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyr61P18406 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyr61P18406 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyr61P18406 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cyr61P18406 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cyr61P18406 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cyr61P18406 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cyr61P18406 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cyr61P18406 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms