Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtpraP18052 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtpraP18052 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtpraP18052 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtpraP18052 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtpraP18052 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtpraP18052 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtpraP18052 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtpraP18052 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtpraP18052 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtpraP18052 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtpraP18052 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtpraP18052 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtpraP18052 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtpraP18052 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PtpraP18052 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtpraP18052 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtpraP18052 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtpraP18052 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtpraP18052 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtpraP18052 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtpraP18052 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtpraP18052 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtpraP18052 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtpraP18052 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtpraP18052 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtpraP18052 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtpraP18052 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtpraP18052 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtpraP18052 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtpraP18052 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtpraP18052 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtpraP18052 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtpraP18052 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtpraP18052 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PtpraP18052 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtpraP18052 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtpraP18052 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtpraP18052 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtpraP18052 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtpraP18052 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtpraP18052 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtpraP18052 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtpraP18052 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtpraP18052 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PtpraP18052 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtpraP18052 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtpraP18052 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtpraP18052 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtpraP18052 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtpraP18052 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtpraP18052 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtpraP18052 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtpraP18052 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PtpraP18052 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtpraP18052 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtpraP18052 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtpraP18052 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtpraP18052 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtpraP18052 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtpraP18052 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtpraP18052 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtpraP18052 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtpraP18052 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtpraP18052 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtpraP18052 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtpraP18052 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtpraP18052 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtpraP18052 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtpraP18052 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtpraP18052 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PtpraP18052 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtpraP18052 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtpraP18052 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtpraP18052 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtpraP18052 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtpraP18052 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtpraP18052 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtpraP18052 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtpraP18052 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtpraP18052 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtpraP18052 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtpraP18052 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtpraP18052 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtpraP18052 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtpraP18052 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PtpraP18052 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtpraP18052 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtpraP18052 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtpraP18052 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtpraP18052 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PtpraP18052 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtpraP18052 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtpraP18052 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PtpraP18052 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtpraP18052 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtpraP18052 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtpraP18052 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtpraP18052 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtpraP18052 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms