Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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