Protein–RNA interactions for Protein: P17433

Spi1, Transcription factor PU.1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spi1P17433 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spi1P17433 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spi1P17433 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spi1P17433 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spi1P17433 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spi1P17433 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms