Protein–RNA interactions for Protein: P14733

Lmnb1, Lamin-B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmnb1P14733 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lmnb1P14733 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lmnb1P14733 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lmnb1P14733 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lmnb1P14733 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lmnb1P14733 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lmnb1P14733 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lmnb1P14733 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lmnb1P14733 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lmnb1P14733 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lmnb1P14733 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lmnb1P14733 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lmnb1P14733 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lmnb1P14733 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lmnb1P14733 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lmnb1P14733 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lmnb1P14733 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lmnb1P14733 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lmnb1P14733 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lmnb1P14733 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Lmnb1P14733 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lmnb1P14733 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lmnb1P14733 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lmnb1P14733 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lmnb1P14733 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lmnb1P14733 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lmnb1P14733 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lmnb1P14733 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lmnb1P14733 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lmnb1P14733 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Lmnb1P14733 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lmnb1P14733 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lmnb1P14733 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lmnb1P14733 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lmnb1P14733 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lmnb1P14733 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lmnb1P14733 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lmnb1P14733 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lmnb1P14733 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lmnb1P14733 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lmnb1P14733 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lmnb1P14733 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lmnb1P14733 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lmnb1P14733 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lmnb1P14733 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lmnb1P14733 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lmnb1P14733 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lmnb1P14733 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lmnb1P14733 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lmnb1P14733 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lmnb1P14733 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lmnb1P14733 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Lmnb1P14733 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lmnb1P14733 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Lmnb1P14733 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lmnb1P14733 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lmnb1P14733 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lmnb1P14733 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lmnb1P14733 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lmnb1P14733 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lmnb1P14733 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lmnb1P14733 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lmnb1P14733 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lmnb1P14733 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lmnb1P14733 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lmnb1P14733 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lmnb1P14733 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lmnb1P14733 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lmnb1P14733 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lmnb1P14733 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lmnb1P14733 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lmnb1P14733 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Lmnb1P14733 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lmnb1P14733 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Lmnb1P14733 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lmnb1P14733 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Lmnb1P14733 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lmnb1P14733 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lmnb1P14733 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lmnb1P14733 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lmnb1P14733 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lmnb1P14733 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lmnb1P14733 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmnb1P14733 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmnb1P14733 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmnb1P14733 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmnb1P14733 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmnb1P14733 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmnb1P14733 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmnb1P14733 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmnb1P14733 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmnb1P14733 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmnb1P14733 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmnb1P14733 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmnb1P14733 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmnb1P14733 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmnb1P14733 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmnb1P14733 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmnb1P14733 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmnb1P14733 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms