Protein–RNA interactions for Protein: P14431

H2-Q9, H-2 class I histocompatibility antigen, Q9 alpha chain (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q9P14431 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-Q9P14431 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-Q9P14431 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-Q9P14431 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-Q9P14431 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-Q9P14431 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-Q9P14431 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-Q9P14431 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-Q9P14431 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-Q9P14431 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-Q9P14431 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-Q9P14431 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-Q9P14431 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-Q9P14431 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-Q9P14431 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-Q9P14431 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-Q9P14431 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-Q9P14431 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-Q9P14431 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-Q9P14431 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-Q9P14431 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-Q9P14431 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-Q9P14431 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-Q9P14431 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-Q9P14431 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-Q9P14431 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-Q9P14431 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-Q9P14431 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-Q9P14431 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-Q9P14431 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-Q9P14431 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-Q9P14431 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-Q9P14431 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-Q9P14431 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-Q9P14431 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-Q9P14431 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-Q9P14431 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-Q9P14431 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-Q9P14431 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-Q9P14431 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-Q9P14431 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-Q9P14431 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-Q9P14431 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-Q9P14431 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-Q9P14431 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-Q9P14431 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-Q9P14431 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-Q9P14431 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-Q9P14431 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-Q9P14431 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-Q9P14431 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-Q9P14431 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-Q9P14431 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-Q9P14431 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-Q9P14431 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-Q9P14431 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-Q9P14431 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-Q9P14431 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-Q9P14431 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-Q9P14431 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-Q9P14431 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-Q9P14431 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-Q9P14431 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-Q9P14431 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-Q9P14431 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-Q9P14431 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-Q9P14431 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-Q9P14431 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-Q9P14431 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-Q9P14431 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-Q9P14431 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-Q9P14431 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-Q9P14431 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-Q9P14431 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-Q9P14431 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-Q9P14431 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-Q9P14431 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-Q9P14431 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-Q9P14431 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-Q9P14431 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-Q9P14431 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-Q9P14431 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-Q9P14431 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-Q9P14431 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-Q9P14431 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-Q9P14431 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-Q9P14431 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-Q9P14431 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-Q9P14431 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-Q9P14431 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-Q9P14431 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-Q9P14431 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-Q9P14431 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-Q9P14431 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-Q9P14431 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-Q9P14431 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-Q9P14431 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-Q9P14431 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-Q9P14431 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-Q9P14431 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms