Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vpreb2P13373 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms