Protein–RNA interactions for Protein: P11370

Fv4, Retrovirus-related Env polyprotein from Fv-4 locus, mousemouse

Predictions only

Length 679 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fv4P11370 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Fv4P11370 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fv4P11370 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fv4P11370 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fv4P11370 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Fv4P11370 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fv4P11370 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fv4P11370 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fv4P11370 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fv4P11370 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Fv4P11370 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Fv4P11370 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fv4P11370 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Fv4P11370 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Fv4P11370 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Fv4P11370 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Fv4P11370 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Fv4P11370 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Fv4P11370 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Fv4P11370 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Fv4P11370 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Fv4P11370 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Fv4P11370 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Fv4P11370 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Fv4P11370 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Fv4P11370 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Fv4P11370 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Fv4P11370 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Fv4P11370 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Fv4P11370 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Fv4P11370 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Fv4P11370 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Fv4P11370 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Fv4P11370 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Fv4P11370 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Fv4P11370 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Fv4P11370 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Fv4P11370 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Fv4P11370 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Fv4P11370 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Fv4P11370 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Fv4P11370 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Fv4P11370 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Fv4P11370 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Fv4P11370 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Fv4P11370 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Fv4P11370 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Fv4P11370 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Fv4P11370 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Fv4P11370 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fv4P11370 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fv4P11370 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fv4P11370 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fv4P11370 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fv4P11370 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fv4P11370 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Fv4P11370 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fv4P11370 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fv4P11370 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fv4P11370 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fv4P11370 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fv4P11370 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fv4P11370 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fv4P11370 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fv4P11370 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fv4P11370 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fv4P11370 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fv4P11370 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Fv4P11370 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fv4P11370 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fv4P11370 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fv4P11370 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fv4P11370 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fv4P11370 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fv4P11370 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Fv4P11370 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Fv4P11370 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Fv4P11370 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Fv4P11370 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Fv4P11370 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Fv4P11370 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Fv4P11370 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Fv4P11370 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Fv4P11370 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Fv4P11370 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Fv4P11370 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Fv4P11370 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Fv4P11370 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Fv4P11370 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Fv4P11370 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Fv4P11370 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Fv4P11370 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Fv4P11370 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Fv4P11370 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Fv4P11370 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Fv4P11370 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Fv4P11370 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Fv4P11370 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Fv4P11370 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Fv4P11370 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms