Protein–RNA interactions for Protein: P11369

Pol, LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP11369 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PolP11369 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PolP11369 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PolP11369 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PolP11369 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PolP11369 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PolP11369 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PolP11369 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PolP11369 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PolP11369 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PolP11369 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PolP11369 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PolP11369 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PolP11369 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PolP11369 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PolP11369 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PolP11369 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PolP11369 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PolP11369 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PolP11369 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PolP11369 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PolP11369 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PolP11369 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PolP11369 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PolP11369 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PolP11369 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PolP11369 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PolP11369 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PolP11369 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PolP11369 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PolP11369 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PolP11369 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PolP11369 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PolP11369 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PolP11369 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PolP11369 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PolP11369 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PolP11369 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PolP11369 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PolP11369 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PolP11369 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PolP11369 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PolP11369 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PolP11369 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PolP11369 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PolP11369 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PolP11369 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PolP11369 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PolP11369 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PolP11369 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PolP11369 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PolP11369 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PolP11369 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PolP11369 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PolP11369 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PolP11369 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PolP11369 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PolP11369 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PolP11369 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PolP11369 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PolP11369 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PolP11369 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PolP11369 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PolP11369 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PolP11369 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PolP11369 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PolP11369 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PolP11369 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PolP11369 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PolP11369 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PolP11369 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PolP11369 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PolP11369 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PolP11369 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PolP11369 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PolP11369 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PolP11369 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PolP11369 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PolP11369 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PolP11369 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PolP11369 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PolP11369 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PolP11369 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PolP11369 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PolP11369 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PolP11369 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PolP11369 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PolP11369 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PolP11369 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PolP11369 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PolP11369 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PolP11369 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PolP11369 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PolP11369 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PolP11369 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PolP11369 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PolP11369 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PolP11369 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PolP11369 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PolP11369 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms