Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P10404 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
P10404 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
P10404 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P10404 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
P10404 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P10404 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
P10404 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P10404 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P10404 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P10404 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
P10404 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P10404 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P10404 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P10404 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P10404 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
P10404 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P10404 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P10404 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
P10404 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P10404 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P10404 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P10404 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P10404 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
P10404 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P10404 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P10404 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P10404 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P10404 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P10404 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P10404 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P10404 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
P10404 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P10404 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P10404 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P10404 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P10404 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P10404 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
P10404 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P10404 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
P10404 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P10404 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P10404 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P10404 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
P10404 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P10404 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P10404 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P10404 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P10404 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P10404 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
P10404 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P10404 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
P10404 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
P10404 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
P10404 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
P10404 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
P10404 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P10404 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P10404 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
P10404 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P10404 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
P10404 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
P10404 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P10404 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P10404 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P10404 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P10404 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P10404 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P10404 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P10404 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P10404 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
P10404 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P10404 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P10404 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
P10404 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P10404 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P10404 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
P10404 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P10404 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P10404 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
P10404 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
P10404 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
P10404 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
P10404 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P10404 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
P10404 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
P10404 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
P10404 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P10404 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
P10404 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P10404 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P10404 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P10404 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P10404 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P10404 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P10404 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P10404 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P10404 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
P10404 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P10404 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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